上海交通大學王牌專業如下：
機械工程、控制科學與工程、船舶與海洋工程、材料科學與工程、信息與通信工程、動力工程及工程熱物理和生物醫學工程；臨床醫學、口腔醫學、基礎醫學；科學技術史、生物學。
除了科學技術史，其他11個專業都是壹級學科國家重點學科，其中，臨床醫學、生物學、基礎醫學、口腔醫學、信息與通信工程下切二級學科國家重點學科。
上海交通大學的最頂尖專業都是熱門專業，這也是上海交通大學歷年分數線高的原因之壹。
上海交通大學12個最頂尖專業排名。
根據排名機構對上海交通大學各專業負值後，得出排名：
機械工程、船舶與海洋工程、臨床醫學，穩居前三名！
動力工程及工程熱物理、控制科學與工程兩個工科學科進入前五名。
生物學、科學技術史，這兩個理學專業，分別第六名、第七名。
口腔醫學、基礎醫學，兩個醫學專業位居第八名、第九名。
生物醫學工程、材料科學與工程、信息與通信工程，這三個工科學科分別位居第十名、第十壹名、第十二名。
上海交通大學（Shanghai Jiao Tong University），簡稱“上海交大”，位於上海，是中華人民***和國教育部直屬、上海市***建、中央直管的全國重點大學，位列國家“雙壹流”“985工程”“211工程”，為九校聯盟、環太平洋大學聯盟、21世紀學術聯盟、中國大學校長聯誼會、Universitas 21、國際應用科技開發協作網、新工科教育國際聯盟、亞洲校園成員。
上海交通大學是入選“珠峰計劃”、“強基計劃”、“111計劃”、“2011計劃”、卓越醫生教育培養計劃、卓越法律人才教育培養計劃、卓越工程師教育培養計劃、卓越農林人才教育培養計劃、國家建設高水平大學公派研究生項目、中國政府獎學金來華留學生接收院校、學位授權自主審核單位。