它起著極其重要的作用。基因組序列中約30%的基因編碼膜蛋白，其中50%是目前已知的。
然而，目前我們在分子水平上對膜蛋白結構和功能的了解遠不如對可溶性蛋白的了解。
質量。目前PDB數據庫中膜蛋白的三維結構數量只占全部結構的1%。目前市場上50%以上的藥物是通過膜蛋白發揮作用的。
天然生物中膜蛋白的含量很低，所以普通的天然生物不適合作為制備膜蛋白的原料。
由於缺乏足夠的膜插入和折疊過程或表達的靶蛋白的翻譯後修飾，異源過表達的膜蛋白通常具有低表達水平或無活性。此外，過度表達的膜蛋白對細胞有毒性作用。因此，膜蛋白的表達、純化和分析遇到了巨大的挑戰。令人驚訝的是，到目前為止，大量的膜蛋白，尤其是來自細菌的膜蛋白，已經被成功地在分子水平上過量表達、分離純化和鑒定。此外，科學家們還完成了對不同組織中幾種膜蛋白組的鑒定。目前，世界上許多膜蛋白實驗室正在努力工作，對膜蛋白的基因操作已經開始出現。這些策略對於膜蛋白的研究非常有用。