南方醫科大學有19學院(含康達學院)和15承擔臨床住院醫師班的綜合、專科附屬醫院。學校本部現有在職教職工1800余人，其中專任教師986人。現有教授313人，副教授268人，博士生導師759人，碩士生導師2477人。
目前，學校擁有壹級學科(生物學、基礎醫學、臨床醫學、口腔醫學、公共衛生與預防醫學、藥學、醫學技術、護理學)8個博士學位授權點，2個學科54個博士學位授權點，4個跨學科博士學位授權點(人文學科、衛生政策與管理、臨床醫學工程、生殖醫學)。
壹級學科11個碩士學位授權點，二級學科65個碩士學位授權點；博士後科研流動站6個，學位授權點已覆蓋醫、理、工、管、法、教、文等7個學科。
科研機構:
學校擁有1個國家重點實驗室，1個國家國際聯合研究中心，1個省級協同創新中心，3個部級重點實驗室，23個省級重點實驗室(工程中心)，2個省級協同創新中心。
擁有國內壹流的醫學模擬教育中心(MSC)和自主學習中心，以及江蘇省知名的醫學動物實驗基地。擁有江蘇省唯壹的省級衛生政策智庫健康江蘇研究院和江蘇省唯壹的轉化醫學研究機構。
以上內容參考:官網-學校簡介，南京醫科大學。