第壹:中科院作為國家專業研究機構，很多都是與國民經濟沒有直接關系的基礎學科。除了極其有限的科研機構，這些專業基本沒有其他就業市場。中科院擴招前，原來培養的研究生大多是自己的接班人，畢業後大多留在中科院。但是現在，不僅每年招生人數是以前的幾倍，而且各個研究所的在職編制也基本飽和。
第二:中科院研究生工資雖然比大學高，但正是因為中科院給的工資“高”，基本不允許學生到外面實習，這也造成中科院學生掌握的研究項目和技能壹定程度上與商業社會中的要求脫軌，缺乏社會實際工作經驗，性格比較書生氣，與社會文化氛圍不符。