北京交通大學是教育部直屬大學。1981北京交通大學成為全國首批授予博士、碩士學位的單位之壹。學校擁有壹級學科博士學位授權點21個，壹級學科碩士學位授權點35個，專業學位授權點10個，其中工程碩士學位授權點招收培養工程碩士研究生21人。
各學科在人才培養和科學研究方面都有很強的實力。國家壹級重點學科2個，國家二級重點學科2個，省部級重點學科3個，省部級重點學科10個，省部級交叉學科2個。現有博士生導師359人，碩士生導師880人，其中國務院學科評估組成員5人。