廈工將實行“2+2”模式，每年選拔30-50名學習成績優異的學生到交大學習兩年，學習經歷由教育部確認。同時，廈工的學生可以報考交大的碩士，符合條件的可以優先錄取。在人才培養方面，兩校還將實行聯合培養研究生的新模式，幫助廈門工學院積累研究生培養經驗。
在師資合作方面，Xi交大每年為廈工提供壹定數量的在職博士學位機會，並接受壹定數量的教師短期學習和考察訪問。同時，廈工學院將選拔壹批符合安交大條件的中青年教師進入交大研究生招生目錄，開展研究生指導工作。廈門理工學院還將進壹步拓展Xi交通大學在東南沿海地區的教學和創新基地。未來，兩校還將在新技術研究院、大學生創新創業培訓等方面開展深度合作。