南校區位於豐滿區。校園占地面積110000平方米。目前，來自法學院、馬克思主義學院、文科學院、歷史文化學院、數學與統計學院、物理學院、化學與生物學院、教育科學學院、繼續教育學院等單位和部門的師生在南校區學習和工作。
北校區位於吉林市龍潭區。校園占地23萬平方米。目前，電氣與信息工程學院、機械工程學院、計算機科學與技術學院、體育學院、工程訓練中心等單位和部門的師生在北校區學習和工作。
東校區位於美麗的松花江南岸。壹期工程於2003年竣工並投入使用。校園占地46萬平方米。現有學校機構，信息技術與傳媒學院、外國語學院、公共外語教育學院、音樂學院、美術學院、醫學部、基礎醫學院、公共衛生學院。
第壹臨床醫學院包括醫學院、醫學檢驗學院、口腔醫學院、護理學院、藥學院、經管學院、林學院、汽車與建築工程學院、大學外語教研室、國際交流學院、後勤集團等單位和部門的師生在東校區學習和工作。