2000年7月，山東大學、山東醫科大學、山東工業大學合並組建新山東大學後，山東醫科大學基礎醫學院和臨床醫學系組成醫學院，成為山東大學最大的學院。2012年5月，山東大學齊魯醫學院成立，醫學院成為其附屬學院。
經過百年的努力，醫學院形成了“求實他人，求實廣智”和“精益求精，無私奉獻”的優良傳統。以培養醫術精湛、醫德高尚、具有國際視野和社會責任感的醫學人才為歷史使命，為改善民生、促進人民健康做出了巨大貢獻。