壹般來說，論文指的是議論文，有研究著作。在學術界，壹般指學術含量比較高的文章。論文是作者根據自己在科研、臨床、教學中的成果、經驗和體會，經過嚴密的邏輯論證和規範化而形成的書面作品，是文章中最典型、最有代表性的文體。
專著是指壹個專門的研究課題，是作品的別稱，其最終的學術成果是以書的形式出現的。
第二，字數
論文字數比較少，壹般在3000-8000字左右；但專著少則四五萬本，多則幾萬、幾十萬本。
三、識別標準
目前國內還沒有鑒定“論文”的標準和方法。壹般論文參考科研論文中的溫哥華論文格式，全文由中英文摘要、關鍵詞、前言、材料(物)和方法、結果、討論和參考文獻組成。摘要是結構化的摘要，包括目的、方法、結果和結論四個部分。符合上述條件的論文壹般被視為“論文”，這是醫學論文體裁中常見的表現形式。
專著已經形成了明確的體系和規範的寫作格式。從格式上看，專論的格式比論著更復雜。