學校擁有博士學位授權壹級學科9個，二級學科授權博士學位68個，壹級學科授權碩士學位24個，二級學科授權碩士學位155個；1國家重點學科(中國現當代文學)，1國家重點學科(教育學原理)，17山東省“十壹五”重點學科，15校級重點學科。
是國務院學位委員會和教育部批準的12專業學位培養單位，包括教育學碩士、公共管理碩士、工商管理碩士、體育學碩士、文學碩士、漢語國際教育碩士、工學碩士、翻譯碩士、國際商務碩士、應用心理學碩士、新聞與傳播學碩士、旅遊管理碩士。學校現有22個學院、4個中心、26個研究生培養單位，全日制博士、碩士研究生4500余人，非全日制研究生3000余人。
山東師範大學研究生院於2006年6月在原研究生辦(成立於1994)的基礎上成立。主要負責學校學科建設、學位和研究生教育的規劃、協調、管理和服務。目前設有研究生招生處、培養處、學位處、學科建設處、專業學位管理中心五個機構。