福州大學於2005年開始設立研究生院。學校有8400多名研究生。是福建省唯壹的專業學位研究生教育綜合改革試點高校，國家工科研究生教育創新型高校。
2012 12福州大學研究生院正式成立，將為福州大學東南創業學院的建設搭建更加廣闊的平臺，從更高的起點上推進學位與研究生教育。
學校現有全日制學生近3萬人，其中博士研究生近5000人，各專業研究生2000余人。建校以來，為國家培養全日制碩士和本科畢業生超過65438+萬人。
這所大學是經中國人民和教育部批準招收港澳臺本科生和研究生的大學。學校擁有兩個國家級人才培養基地，三個國家級實驗教學示範中心，320多個省內外校外實踐教學基地。