理論經濟學方面，南京大學84分，排名第六，浙江大學81分，排名第七，排名非常接近。
壹般來說，綜合類大學相對於金融類院校，普遍更重視理論經濟學，這可能也是由於與“研究型”大學的對稱性。
但從兩校兩個學科最高教學水平的建設，也可以看出浙大和南大在應用經濟學各個專業的比較優勢。除了產業經濟學，兩個都有博士點，浙大有世界經濟和國際貿易博士點(另壹個是勞動經濟學)；NTU金融是應用經濟學的兩個博士項目之壹。
也就是說，申請應用經濟學專業，側重金融的可以考慮南京大學，側重國際貿易的可以側重浙大。