該方向為交叉學科，包括(1)汙染水體和土壤的生物修復機理、過程和效率；(2)生物制劑及制品的研究與開發；(3)廢棄生物資源的轉化。其中結合現代先進的生物技術和手段進行汙染修復，生物制劑的研發和廢棄物資源的轉化具有特色。