上海科技大學成立於1958，由中國科學院上海分院負責，正式成立於1959。郭沫若同誌題寫了校名。首任院長是中科院上海分院副院長周仁。上海科技大學的主要院系是在上海中科院各研究所的幫助下創建的，部分系主任由上海中科院研究所所長或副所長兼任。