我們新余學院有13個二級學院，分別是:
新能源科學與工程學院、機電工程學院、數學與計算機學院、建築與工程學院、中興通訊信息學院、文學與傳媒學院、外國語學院、經濟與管理學院、公共衛生與健康學院、藝術學院、體育學院。
其中，機電工程學院從1993在新余學院設立的工程系開始，歷經了機電工程系、機械工程學院等變革。2010開始本科教育，2018與江蘇大學材料科學與工程學院合作開始研究生聯合培養。
新能源科學與工程學院，前身是太陽能科學與工程系，創建於2007年。