我校有兩套綜合教務管理系統同時運行，正在進行新舊系統的數據遷移和新教務系統功能的完善。預計從2007年開始，新的教務管理系統將在全校範圍內推廣使用。
新的綜合教務管理系統采用C/S和B/S相結合的模式，緊緊圍繞學校的教務管理活動。包括學籍管理、課程數據庫管理、教學計劃管理、理論教學任務安排、實驗教學管理、教學過程安排、選課管理、考試安排、成績管理、綜合復習、教材管理、教學評價、教師工作量管理、學生網上綜合系統、教師網上綜合系統、院系網上綜合系統等19個功能模塊，基本涵蓋了我校教學管理的所有流程，並兼顧二者。
綜合教務管理系統的使用對規範教學管理、提高工作效率起到了積極的作用。