有10個研究所:經濟研究所、企業研究所、金融研究所、城鄉研究所、農業研究所、法學研究所、社會學研究所、哲學研究所、文史研究所、國家研究所，以及非編制地區研究所和重慶市三個代表理論研究中心(辦公室設在我院，在我院掛牌)。三個聯辦(所):重慶市社會科學院渝中分院、大足石雕藝術研究院、(南川)旅遊經濟文化研究院。三個研究中心:決策咨詢研究中心、城鎮與區域發展研究中心、南亞研究中心。1雜誌:《改革》雜誌，負責編輯出版《改革》、《重慶經濟年鑒》、《重慶藍皮書》、《領導決策參考》等刊物。1圖書情報機構:文獻信息中心。八個行政部門:辦公室、科研組織部、聯絡處、人事部、財務部、黨委、資源開發部、培訓中心。重慶直轄後，受重慶市職稱改革領導小組委托，我院設立重慶市社科研究系列高級評委和中級評委，接受全市社科研究系列職稱評審。
醫院占地7畝，固定資產300多萬元，藏書7萬冊。
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