中國海洋大學的研究生專業為應用經濟學、統計學、法學、政治學、中國語言文學、外國語言文學、中國歷史、數學和物理。
化學、地理學、海洋科學、地質學、生物學、生態學、機械工程、光學工程、材料科學與工程、信息與通信工程、控制科學與工程、計算機科學與技術專業。
以及土木工程、水利工程、化學工程與工藝、地質資源與地質工程、環境科學與工程、食品科學與工程、軟件工程、管理科學與工程、水產、藥學、管理科學與工程、工商管理等專業。
學科建設
截止2018，12年末，學校為全國首批工程博士專業學位授權點，具備招收職校教師在職攻讀碩士學位資格。博士後科研流動站13個，國家壹級重點學科2個，2個學科國家重點學科10個(其中重點培養學科1個)。
山東省文化藝術學“十二五”重點學科1個，其中博士學位授權壹級學科16個，博士學位授權學科85個，博士學位授權學科1個，碩士學位授權壹級學科35個，碩士學位授權學科194個，碩士學位授權學科17個。