復旦大學和雲南大學實行“聯合本科培養計劃”。雲南大學每年從漢語言文學、歷史學、哲學、新聞學、社會工作、數學與應用數學(含基礎數學科學)、物理學(含基礎數學科學)、化學、生物科學(含基礎生物課)、生態學等十個專業選拔五名全日制新生，參加“聯合本科生培養計劃”。
聯合培養學生采用“1+2+1”的模式，即學生壹、四年級在雲南大學學習，二、三年級在復旦大學學習。
聯合培養的學生畢業時，能取得我院畢業證、學位證，符合復旦大學要求的，在雲南大學畢業證、學位證上加蓋復旦大學印章。