沈陽藥科大學的專業有:藥學、藥物制劑、藥物分析、國家理科基礎藥學基地班(八年制本科)、藥學(日語強化課程、五年制課程)、藥學(英語強化課程、五年制課程)、制藥工程、環境科學、應用化學、藥物化學、中藥、中藥資源與開發、藥學(食品藥學)、中藥藥學等等。前兩年半在吉林大學學習基礎學科,第六學期回校研究生課程),工商管理,市場營銷,國際貿易與經濟,藥事管理,生物醫學工程。
這個學校最好的專業是藥學,藥學基礎班和強化班比較受歡迎。藥物制劑、中藥、藥物分析、藥物化學、生物技術制藥也是特色專業,也是錄取分數比較高的專業。
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