上海海事大學是壹所以航運、物流、海洋為特色的多學科大學，學科門類包括工程、管理、經濟、法律、文學、科學、藝術等。
科研機構
截至2021年5月，學校擁有省部級重點研究基地16個，其中教育部工程研究中心2個，教育部科技查新工作站1個，交通運輸部重點實驗室1個，上海市高校知識服務平臺高級戰略研究中心1個，上海市科委工程研究中心1個。
上海市工程技術研究中心5個，上海市高校人文社會科學重點研究基地2個，上海市社會科學創新研究基地1個，上海市人民政府發展研究中心1個。有上海海事大學海洋材料科學與工程研究所、物流科學與工程研究所等科研機構，學校下屬上海國際航運研究中心。