主要有兩個區別:(1)培養目標:學術型研究生側重培養學術理論研究型人才；專業學位研究生重點培養某壹專業(或職業)領域具有良好職業素質的高級應用型專門人才。(2)培養方式:學術型研究生的課程設置側重於加強基礎理論的學習，培養學生科研創新的能力和素質；專業學位研究生的課程設置以實際應用為導向，以綜合素養和應用知識與能力的提高為核心。教學內容強調理論與應用課程的有機結合，突出案例分析和實踐研究。在教學過程中，強調團隊學習、案例分析、實地調研、模擬訓練等方法，強調研究實際問題的意識和能力。
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