南京大學的前身是三江師範學校，成立於1902。期間先後更名為兩江師範、南京師範學院、國立東南大學、第四中山大學(1927)、江蘇大學(1927)、國立中央大學(1928)，1949定名為南京大學。
金陵大學堂創建於1910。1952國家院系調整時，南京大學的工、農、師等相關院系獨立，同時並入金陵大學文理學院，仍命名為南京大學。因此，金陵大學是南京大學的另壹個重要生源。
南京大學的校徽有盾形的設計風格，是中央大學傳下來的。校徽左下方和右下方是英文“南京大學”。南大校徽將特定色值的紫色確定為標準色，命名為南大紫。
校徽中央是南京-雪松，象征南大不屈不撓的精神。雪松下面是壹個書的圖案和“1902”的字樣，表明南京大學創辦於1902。
校徽中間有“南京”藝術字體組成的圓形圖案，兩側有金陵神獸(猛獸)，是南京的象征。