長江大學研究生教育管理機構成立於2004年3月，先後命名為研究生辦公室和研究生院。2012年正式更名為長江大學研究生院。現設有招生辦、培訓辦、學位辦、質量控制辦、武漢校區管理辦等五個部門，負責全校的學科建設和研究生教育管理。
學校學歷和研究生教育起源於1983。於1986年經國務院批準為具有碩士學位授予權的高校(原江漢石油學院)。2006年被授予博士學位授予權，2009年被批準為博士後科研流動站。
經過30多年的發展，基本形成了學位授權層次齊全、學位授權點分布廣泛、學位點結構優化合理、導師隊伍強大、研究生學科、專業、教學和科研培養平臺建設等良好局面。已初具規模，研究生結構日益優化，規模穩步增長，研究生教育體制機制不斷完善，研究生獎學金制度日臻完善，人才培養質量穩步提高。