1 .四牌樓
校園地址:南京市中心玄武區四牌樓2號。校園是研究生教育、高年級本科教育、繼續教育(醫學科目除外)和科學技術研究的基地。
2.丁家橋
校園地址:鼓樓區丁家橋。校園是醫學教育和科學研究的基地，也是東南大學附屬仲達醫院的所在地。
3.九龍湖
校園地址:江寧經濟技術開發區南側。九龍湖校區建築規劃以東南大學的歷史文脈為背景，采用公立* * *核心教學組團與專業教學組團相結合的校園建築形式。九龍湖校區建立了教學區、科研實驗區、行政區、本科生生活區、研究生生活區、教師生活區、後勤保障區等。
4.無錫校區
校園地址:無錫太湖國際科技園。目標是培養電子信息領域的高層次人才。