東南大學長江特聘教授項目、生命科學專家呂祖洪贊助大賽，大賽的成功在研究生中產生了巨大反響。2004年，東南大學研究生院和南京師範大學研究生部聯合邀請部分高校研究生院領導做商科研究生建模。南京籌備會後，東南大學、南京師範大學、南京大學、南京理工大學、同濟大學、河海大學、武漢大學、南京航空航天大學、山東大學、南昌大學、中國科學技術大學、國防科技大學、中國礦業大學、解放軍信息工程大學、解放軍理工大學、中南大學、華南理工大學、吉林大學、Xi交通大學、中山大學、合肥工業大學、廈大等四川大學、上海交通大學、哈爾濱工業大學等26所研究生院壹致決定，聯合發起全國研究生數學建模競賽，成立競賽組委會和競賽評審委員會，制定競賽章程和規則。
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