上海理工大學從1978開始招收研究生，是國務院學位委員會批準的全國首批高校之壹。中國工程院院士6人(含雙聘)，全國名師1人。目前在校研究生4300余人，其中博士生280余人。現有博士生導師78人，碩士生導師470余人。
上海理工大學研究生院(黨委研究生工作部、學科建設辦公室)下設招生辦公室、培訓辦公室、專業學位辦公室、學位辦公室、學科建設辦公室、質量評估辦公室、學生工作辦公室、綜合管理辦公室。