1970-1988留校任教，歷任清華大學黨辦副主任、機械系黨委副書記。
1988-1993兩次赴德國合作研究，獲得德國亞琛工業大學工學博士學位。
1993-2002年任清華大學教授、博士生導師、清華大學院長，兼任清華大學研究生院副院長。
清華大學深圳研究生院院長。
2002年8月——經福建省委與清華大學協商，出任福州大學校長。
2010 —吳民生同誌因年齡原因，不再擔任福州大學校長職務。
2011 1 ——清華大學深圳研究生院港澳研究中心主任。
2013 10 13，中國科學院深圳先進技術研究院正式聘請吳民生教授為院長顧問。