西南大學研究生院是西南大學負責研究生培養的專門機構。西南大學由原教育部直屬的西南師範大學和原農業部直屬的西南農業大學於2005年合並而成。原兩校相鄰而建，均可追溯到1906成立的川東師範學校。1936更名為四川省教育學院。
1950年，四川省立教育學院與1940創辦的國立女子師範學院和1946創辦的私立湘會文法學院合並，分別成立西南師範學院和西南農學院。
65438至0985，兩校分別更名為西南師範大學和西南農業大學。此後，重慶輕工職工大學、四川畜牧獸醫學院、中國農業科學院柑橘研究所合並。