軍醫大學畢業生去主要有兩種情況。首先，有軍籍的學員在取得畢業證後，可能會先被分配到部隊基層連隊服役，之後根據其專業和醫療成績的發展情況，可能會被轉到地方軍隊醫院繼續深造。其次，非軍籍學生畢業後可能會被分配到軍隊醫院、各軍兵種系統醫院、各軍區附屬醫院，甚至是海軍、陸軍、空軍、火箭軍、聯勤保障部隊的基層連隊。壹般來說，軍醫大學畢業生的分配名額是由軍隊統壹安排的，涵蓋了很多可能的醫療服務領域。