皖南醫學院坐落於被譽為“長江巨埠、安徽脊梁”的歷史名城蕪湖，緊鄰浩瀚長江，匯聚江南美景。學校創建於1958，當時是蕪湖醫學院；1971年並入安徽醫學院，為安徽醫學院皖南分院；1974經國務院批準，學校獨立成立，定名為皖南醫學院。
1981年，學校被國務院學位委員會授予學士學位和碩士學位；1998壹次性通過教育部本科教學工作合格評估；2008年順利通過教育部本科教學水平評估，獲得優秀等級；2018順利通過教育部本科教學工作檢查評估。
學校初步形成了以醫學為主、多學科協調發展、布局合理、特色鮮明的多層次辦學格局。學校臨床醫學學科進入ESI全球排名前1%，入選安徽省頂級學科。本科專業28個，涵蓋醫、理、工、管、經、法6個學科。
該校是全國首批醫學碩士專業學位研究生培養模式改革試點高校。擁有臨床醫學、基礎醫學、生物學、藥學、公共衛生、預防醫學等5個碩士學位授權點，臨床醫學、口腔醫學、藥學、公共衛生、護理學、應用心理學等6個碩士學位授權點。