劉慶昌於1984畢業於山東萊陽農學院，同年獲得北京農業大學碩士學位。65438-0986赴日本國立鹿兒島大學深造，先後獲得碩士和博士學位，成為該校第壹位由日本學術振興會資助的博士後。
1993回北京農業大學任教，1996晉升教授、博士生導師。現任農業部作物基因組與遺傳改良重點開放實驗室主任、北京市作物遺傳改良重點實驗室主任、農業與生物技術學院副院長。兼任中國作物學會及其青年工作委員會主任、甘薯專業委員會副主任、中國農業生物技術學會作物分會副秘書長、國際園藝學會會員、國家甘薯產業技術體系生物技術育種崗位科學家、《作物學報》、《分子植物育種》、《作物雜誌》編委。
劉慶昌教授了《普通遺傳學》、《植物細胞組織培養》、《作物遺傳育種研究生專業英語》、《作物遺傳育種專題》、《作物科學研究進展》等課程，並註重教學內容、方法和手段的改革，教學效果良好。學生的評價是:“專註，旗幟鮮明，特別投入，不廢話。”