學校起源於河南大學堂，創建於1902。先後經歷了河南高等學校、河南高等學校、河南公立農學院、五大農科、河南大學農學院等辦學階段。1952，國家院系調整時，重新獨立組建，更名為河南農學院。1984 12更名為河南農業大學。2009年9月，成為國家農業部和地方省級政府共建的第壹所省屬農業大學。
2018年5月學校官網信息顯示，學校獲得國家教學成果獎6項，國家精品課程7門，國家精品課程資源6項，國家教學團隊1個，國家特色專業7個，國家雙語教學示範課程1個，國家實驗教學示範中心4個，國家人才培養模式創新實驗區60個。
國家卓越農林人才教育培養計劃改革試點8個，國家專業綜合改革試點3個，國家大學生校外實踐教育基地1個，國家農教合作人才培養基地4個，河南省特色專業18個，河南省精品課程18個，河南省實驗教學示範中心6個。