1.第壹:中科院作為國家專業研究機構，很多都是和國民經濟沒有直接關系的基礎學科。除了極其有限的科研機構，這些專業基本沒有其他就業市場。每年招生人數是以前的幾倍，各學院的在職編制基本飽和。
2.第二:中科院研究生的工資雖然比大學高，但正是因為中科院給的工資“高”，所以基本不允許學生在外面實習，這也導致中科院的學生做的科研項目與他們掌握的技能和商業社會中的要求有些脫軌，缺乏社會實際工作經驗，與社會的文化氛圍不符。
擴展數據
中國科學院的教育創新；
據中國科學院官網2016年6月消息，中國科學院面對知識經濟時代的機遇和挑戰，提出建設國家創新體系的思想，實施知識創新工程和“創新2020”，率先建立研究生制度，成立中國科技大學，建立新中國第壹個研究生院，實行學位制度，建立博士後制度。
知識創新工程和“創新2020”實施以來，研究生教育高質量大規模發展，形成了以中國科技大學、中國科學院大學(原中國科學院研究生院)為核心，覆蓋全院科研院所的教育體系。
參考數據
百度百科-中國科學院