2004年8月，根據國務院、中央軍委決定，為進壹步加強地方經濟建設，解放軍第壹軍醫大學整體劃歸廣東省，更名為南方醫科大學。
研究生專業有人體解剖學與組織胚胎學、內科學(消化系統疾病)、中西醫結合臨床實踐、病理學與病理生理外科(骨外)等。