1.獲取難度:國家獎學金的評選由教育部監督實施，總體難度較高。相比之下，北大校長獎學金的評選更加靈活，獲獎比例更高。所以，拿到國家獎學金更光榮，也更艱難。
2.評選標準:國家獎學金的評選標準非常明確，以學生在學習成績、科學研究、創新能力、團隊合作等方面的表現為標準，具有極高的權威性和公信力。北大校長獎學金的評選標準更多的是通過校內綜合評價。