杭州醫學院的前身是浙江女子產科學校，創建於1925。是繼浙江省高等醫學職業學校、浙江省衛生學校、浙江省衛生學校、浙江省醫學院等之後，於2016年升格為醫學本科院校。浙江省醫學科學院的前身是杭州熱帶病研究所，創建於1928。2019原浙江省醫學科學院和原杭州醫學院合並組建新杭州醫學院。
截至2023年3月，學校擁有臨安、濱江、黃龍三個校區和青山湖科技創新中心，占地面積754畝，建築面積39萬平方米。有教學科研儀器設備總值401億元，教學單位15個，本科專業21個，壹級學科碩士點3個，專業碩士點3個，有全日制在校大學生、本科生、研究生* * * 10932人，職業教育從業人員65438人。