學校有16個學院，涵蓋人文、社會科學、理工、農業、醫學等學科。學校有本科、碩士和博士教育，有8個博士學科，34個碩士學科，90多個本科專業。學校以經濟學、環境研究、人文科學、生命科學等學科聞名，環境科學、地理學、民族學、文學、經濟學、農業科學等學科在國內處於領先地位。
同時，雲南大學是中國與東盟自由貿易區人才培養、學術交流和文化交流的重要基地之壹。學校與美國、加拿大、英國、德國、日本、韓國等國家的壹些大學和科研機構保持著良好的合作關系。