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醫學院具有深厚優質的中法醫學教育傳統，通過推進臨床醫學法語班建設和探索中法合作醫學科學碩士課程建設，不斷提升中法醫學教育的引領和示範作用。2013年，“上海交通大學與法國斯特拉斯堡大學聯合培養醫學教育專業博士研究生教育項目”正式獲得教育部批準，成為我國首個醫學博士中外聯合培養項目。