1.教學方式的差異:在職研究生需要利用課余時間在學校上課，或者通過網絡遠程教育平臺在線學習。函授研究生以自主閱讀和自我訓練為主，少量面授課程為輔。
2.學習時間安排的區別:在職研究生是專門為已經就業有工作經驗的人設計的，函授碩士有靈活個性化的方案。