目前有壹級學科8個，二級學科國家重點學科13個，“雙壹流”建設學科15個，江蘇大學優勢學科建設項目三期批準學科19個。江蘇省重點學科18。？
南京大學研究生教育綜合改革，在繼承優良傳統、開創南大的思路下，先後啟動了“4-3-3”博士教育改革和“2-3-3”碩士教育改革。
有39個博士學位授權壹級學科，3個博士學位授權二級學科(不含壹級學科)，2個專業博士學位，5個碩士學位授權壹級學科，28個專業碩士學位。博士後流動站38個，國家基礎學科人才培養基地12個，國家生命科學與技術人才培養基地1個。