澳門六年制臨床醫學專業采用臨床問題導向的教學理念，培養學生批判性思維能力，提升終身學習能力。隨著國家重點實驗室等壹流的教學實驗設備和相關政策的支持，中醫藥學從世界各地引進，學術水平進壹步提高。由此，澳科大的中醫學科成為港澳地區的強勢學科。