農業工程系以國家農業工程壹級學科和農業機械化工程、農產品加工與貯藏工程兩個二級學科市為依托，其中農業機械化工程為國家重點學科。農業工程系設有農業工程、農業機械化工程、機械設計、制造與理論、農產品加工與貯藏工程、農業裝備工程5個研究生培養中心，農業工程、農業裝備工程、農業機械化工程4個博士培養中心，為全國培養了大批學科帶頭人和學科骨幹。其中，農業機械化工程學科已列入“211”項目二期。該系現有教職工50人，其中工程院院士1人，國家有突出貢獻中青年專家2人，部級有突出貢獻中青年專家8人。教授17，副教授18；教師中，碩士及以上學歷占58%，博士學歷占30%。該部門承擔國家“863”、“九五”、“十五”、國家自然科學基金、“948”、國際合作等縱橫項目130余項，科研經費4500余萬元。獲國家、省部級科技獎勵25項，教學成果獎5項，專利35項，發表論文600余篇，其中SCI、EI、ISTP等五大高校檢索文章50余篇，出版專著、教材40余部。目前在研科研項目50余項，科研經費600多萬元。