為滿足我國經濟快速發展對土木工程專業高層次應用型人才的需求，依托南京航空航天大學雄厚的數學、工程力學、計算機、管理等師資力量和完備的教學實驗條件，我院於2006年經江蘇省教育廳批準設立土木工程專業。
依托南京航空航天大學和在省內外知名高校的考察學習，制定了土木工程人才培養方案，以人才培養為重點，切實加強師資隊伍、實驗室和實習基地建設，強化教學過程管理，不斷提高辦學水平。從無到有，努力把土木工程專業打造成應用特色鮮明的專業。