據中國教育在線報道，鄭州大學是河南省最好的綜合性大學，也是全國排名前40的大學。它歷史悠久，文化底蘊深厚，培養了許多優秀人才。其理工科實力較強，尤其是材料科學、化學、工程、臨床醫學等領域。校園環境優美，設施齊全，生活便利。地處中原中心城市鄭州，經濟發展快，就業機會多。南京農業大學是全國最好的農林大學之壹，也是全國排名前50的大學。是壹所以生命科學為特色，涵蓋農、工、理、文、法、經、管等學科的綜合性大學。在生命科學、農業科學、食品科學、環境科學等領域具有國際領先水平。其校園風景優美，氛圍濃厚，文化活動豐富。地處南京，是江蘇省省會城市，長三角地區重要城市，文化底蘊深厚，經濟發達，就業前景廣闊。綜上所述，鄭州大學和南京農業大學都是很優秀的大學，但是鄭州大學排名更高更好。