皖南醫學院包括臨床醫學院、麻醉學院、醫學影像學院、法醫學院、口腔醫學院、護理學院、藥學院、人文與管理學院、公共衛生學院、檢驗學院等。以下是詳細列表，供大家參考。如有變動，以學校最新公告為準。
1，部門設置
臨床醫學院
麻醉學學院
醫學影像學院
法醫學院
口腔醫學院
護理學院
藥學院
人文與管理學院
公共衛生學院
檢驗學院
醫學信息學院
龔* * *基礎學院(創新創業學院)
基礎醫學院
馬克思主義學院
研究所
繼續教育學院