中科院12分支機構排名為中科院北京分院、中科院沈陽分院、中科院長春分院、中科院上海分院、中科院南京分院、中科院武漢分院、中科院廣州分院、中科院成都分院、中科院昆明分院、中科院Xi安分院、中科院蘭州分院、中科院新疆分院。
1，中國科學院北京分院。
中國科學院北京分院是中國科學院的派出機構，成立於2005年3月1日。以壹個機構、兩塊牌子的形式與北京地區黨委合署辦公，負責聯系和管理北京、天津、山西三地的中科院科研院所。
2.中國科學院沈陽分院。
中科院沈陽分院是中科院的派出機構，負責聯系協調遼寧、山東兩省的中科院科研院所。沈陽分院目前有7個法人研究所:遼寧省大連化學物理研究所、金屬研究所、沈陽應用生態研究所和沈陽自動化研究所、山東省海洋研究所、青島生物能源與過程研究所、煙臺海岸帶研究所。