2002年，南京審計大學與南京金融學院合並。
南京審計大學的審計、金融、公共財政是教育部特色專業，財政、金融、管理科學與工程、工商管理、審計是江蘇省“十二五”重點專業，審計、金融是江蘇省品牌專業，金融、會計、工商管理、國際經濟與貿易、信息管理與信息系統是江蘇省特色專業。