生物醫學工程專業包括再生醫學、組織工程、細胞工程、蛋白質工程、基因工程、生物醫學材料五大方向。
學院有5個博士學位授權點(藥理學、微生物學與生化藥學、生物化學與分子生物學、病理學與病理生理學、醫學生物工程)；7個碩士學位授權點(藥理學、藥物化學、藥物分析、微生物與生化藥學、生物化學與分子生物學、病理學與病理生理學、醫學生物工程)；兩個博士後流動站(基礎醫學、生物學)。吉林省重點學科有兩個:藥學和生物醫學工程。