2002年，學校成為教育部主辦的首批啟動“研究生教育創新工程”的高校之壹，並被確定為2010研究生專業學位教育綜合改革試點單位。到2018，學校已經連續8年獲得教育部研究生創新計劃資助。
重慶大學現有理工類、經濟類、管理類、文學類、法律類、藝術類、教育類25個學院，以及研究生院、繼續教育學院、網絡教育學院。全日制在校生5萬余人，其中碩士生、博士生近2萬人，本科生近3萬人，留學生1.200余人。